blog etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster
blog etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster

20 Ağustos 2015 Perşembe

Bir Biyoinformatik Kampından Sonra

Biyoinformatik kampı geçtiğimiz hafta tamamlandı. Dünya'nın işini yaptık.

Anlatmaya nereden başlasam bilemiyorum. Biyoinformatik, lisans eğitimi bulunan ya da sertifikalandırılabilen bir alan değil. Bu durum aslında tek bir şeyi aşırı önemli ve değerli kılıyor, kişisel çaba. Özellikle ülkemizde biyoinformatikle ilgilenmek için kesinlikle bir kişisel ilgiye sahip olmak ve daha da önemlisi kendi yolunuzu kendiniz çizmek durumundasınız. Bu durumun zorluğu çokça çabalamanızın gerekmesi, avantajı ise ülke sınırları içerisinde henüz keşfedilmemiş pek çok yönde kendi yolunuzu açabilme imkanı. Biyoinformatik alanındaki kararlılığı sürdürebilmenin tek yolu bir şekilde sizi bu yolda ilerletecek bir şeyler bulmak. Bu nedenle Türkiye'de biyoinformatik adına atılan her adım geleceği doğrudan şekillendiriyor.

Biyoinformatik kampında da bu alana dair soru işaretlerine cevap verildi. Öte yandan kamp, bu alanda bir kararlılık yakalamak isteyen kişilere kitaplarda bulamayacağı bir şey verdi: Tecrübe. Biyoinformatiğin tanımının henüz yapıldığı ülkemizde bu alanı hayat tarzı belirlemek isteyen kişilere bir tecrübe aktarma ortamı oluşturduğu için kampın düzenleyicisi Ahmet Raşit Öztürk'e kendim adına teşekkür ediyorum.

Kampın asıl süresini 10 kişilik bir ekiple sürdürdük. Bir buçuk ay boyunca http://yazkampi2015.blogspot.com.tr/ blogunda 50'ye yakın yazı yayınladık. Her şeyi aktarmaya çalıştık, bazı şeyleri kendimize sakladık. Nihayetinde Python programlama dilinden moleküler biyolojinin derinlerine, yeni nesil dizilemeden veri analizi teorilerine kadar pek çok şey arasında bağlantı kurduk. Bu kampta yapılan şey biyoinformatiğin tanımını yapmak yani biyoinformatiği oluşturan her şeyin birbiri ile bağlantısı kavramaktı.

Programlama yaptık, veri analizinin mantığını kavramaya çalıştık, takım çalışmasına yoğunlaştık, sert eleştiriler altında sunumlar yaptık, Minecraft, Counter Strike oynadık, hayali şirketler kurduk yatırım topladık, pizza yedik, Türkiye'nin ilk biyoinformatik kodlama maratonunu gerçekleştirdik, blog yazdık, rapor yazdık,  mantı yedik. Kısacası bir Dünya iş yaptık.

Bu kampı değerlendirirken şimdi oldukça rahat söyleyebilirim ki bizi Kayseri'de bir buçuk ay bir arada tutan şeyi, biyoinformatiği anladık. Kendi yolumuzu açmak istediğimizde bize destek olacak bir temel attık. Belki biraz daha fazlasını söylemeye cesaret ederek bu, bizler için bir kişisel gelişim kampı oldu.

Yazının giderek daha romantik bir hal aldığı fark ederek, aldığım ve aktarmak istediğim tavsiyeler kısmına geçmek istiyorum.

Biyoinformatik bahsettiğim gibi Türkiye için oldukça yeni (daha adında bile uzlaşılmış değil bkz. biyoenformatik). Bir yerlerde insanlar bu alanla uğraşıp, hayatlarını bundan kazanıyor; bu alana gönül verip katkı yapmaya çalışıyor. Tüm bu olan biten bir şekilde bir ağın da parçası. Yani Google'da biyoinformatik kelimesini arayarak bir ucundan tutabileceğiniz bu ağ sizi kendi şehrinizde, üniversitenizde biyoinformatik yapan kişilere, bu alanda verilen eğitimlere kadar götürecektir.

Biyoinformatiği tanımak için öncelikle internette bu alanla ilgili vakit geçirmenizi tavsiye ediyorum. Bunu yaparken bu alanda hangi birikimlere ihtiyaç duyulduğunu anlayacaksınızdır. Programlama, moleküler biyoloji, istatistik gibi. Bir ayağınız laboratuvarda mı olacak yoksa tamamen bilgisayarlı biyoloji mi yapacaksınız tüm bu cevapları biyoinformatiği tanıdıkça bulabileceksiniz. Bu süreçte biyoinformatik kursları, kampları, projeleri size yol gösterecektir.

Moleküler biyoloji ve genetik alanında kariyer hedefleyen kişiler, derinleştikçe biyoinformatiğin bu alandaki önemine tanık olmuşlardır. Bu noktada söylenebilecek en doğru şey biyoinformatiğin bir araç olması. Yani bu alanda kariyer yapmayacak bile olsanız, moleküler biyoloji kariyerinizi biyoinformatik aracı ile taçlandırabilirsiniz.

Bizler bu kampa başlarken, biyoinformatikle her fırsatta ilgilenmeye çalışan kişilerdik; bu kamp da o fırsatlardan biriydi. Kimimiz bunu moleküler biyoloji kariyerinde araç olarak kullanacak, kimimiz sadece biyoinformatikte bir kariyer hedefleyecek; bazıları da bambaşka bir yöne gidecek. Kamp, bize bir seçme şansı tanıdı; bu anlamda bizleri dolduran bu eğitim ve eğlence dolu fırsattan minnettar olduğumu belirterek bitirmek istiyorum.

Reklamlar: Bu arada ben Seyit, seyitzor.com adresli blogumda biyoinformatik sekmesi altında bu alana dair bir şeyleri mutlaka paylaşıyor olacağım.

16 Ağustos 2015 Pazar

Kaçınılmaz Son ..

Herkese merhaba !

Dün kampımızın son günüydü. Aslında bu sıfata cuma günü daha layık, zira dün beraber güzel vakit geçirmek adına Hoca'mızın evine kahvaltıya gittik ve günü orada harcadık, bu nedenle de kampa dair bir şey yapmadık. Son günümüzü çok güzel bir şekilde geçirmiş olduk. Unutmadan, dün ve diğer her gün için Ahmet Hocamız, eşi Melike Hanım ve dünyalar tatlısı Bıcırık'a sonsuz döngüye giren bir şekilde teşekkürlerimi iletmek istiyorum. Kampımızın bu denli sıcak olmasındaki etkileri 10 üzeri bir sürü kadar! Buyurun bu da eksikliklerimiz olsa da son beraber fotoğrafımız.



Sabahtan buluşup gittiğimiz  kahvaltıdan sonra hep birlikte sohbet edip, komikli kanallar izleyip insanlara şok olduk.. Daha sonra tabu oynadık ancak zaman kısıtlamamız olduğu için biraz hızlandırılmış bir şekilde oyunu tamamlamak zorunda kaldık. Kim mi kazandı ? Gene dostluk tabii ki! Ne kadar da başarılı bir dostluk, hep kazanıyor.

Daha sonra uzaklara gidecek bizler uçaklarımıza, otobüslerimize doğru yol aldık yavaştan. Neslihan ve ben asla eve ulaşamayacağımızı sanırken ilginçtir ki evlerimize varabildik. Böyle söylememin nedeni 20:30'da olan ve 1 saat sürecek olan uçuşumuzu, gece 3'te eve vararak tamamlayabilmiş olmamız. Bazen yollar o kadar kısa olamayabiliyor maalesef. Ah şu rötar ! 

Stajın genel değerlendirmesini  haftaya yazacağım yazıya saklayacağım için bu yazıyı kısa tutuyorum. Bu nedenle şimdilik kendinize iyi bakın.

Sevgiler :)

FC.

10 Ağustos 2015 Pazartesi

06-08/08/2015 - Til' Next Time, Signing Out...

Hey world! This will be my last post about our Bioinformatics Internship! I have grown wings, and i am flying out of the crew-nest for a test run. Thank you all for following along with me in this amazing journey! A shout out to my mentors, and crew who made this all and event to truly remember. Peace!

9 Ağustos 2015 Pazar

Ağustos 8, 2015

Herkese merhaba, 

Unutkanlığıma verin, dün yazmış olmam gereken blog yazısını biraz gecikmeyle gözlerinizin hizmetine sunuyorum. 

30 Temmuz 2015 Perşembe

Bir Hackathon Geçti

Biyoinformatik kampında 48 saatlik bir kodlama maratonunu tamamladık. Biyo Hackathon adlı bu uygulamada yegane amacımız programlama yaparak biyoinformatik sorunlarına kendi çözümlerimizi getirmekti. Bu hackathon Türkiye'de alanında bir ilk oldu.

Hackathonlar bilgisayar programcılarının, yazılım, grafik veya donanım geliştiricilerin  genellikle yazılım projelerinde iş birliği yaptıkları 24 saat ile 1 hafta arasında süren etkinliklerdir. Biyoinformatik kampında yoğun şekilde ilgilendiğimiz Python programlama dilini kullanarak biyoinformatik alanında programlama deneyimlerimizi artırmak ve 48 saat boyunca tek bir amaca odaklanmak fikriyle bir hackathon düzenledik.