bioinformatics etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster
bioinformatics etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster

22 Ağustos 2015 Cumartesi

Veda Yazısı

Herkese merhaba !

Bu blogdaki son yazım olacak bu yazı, kamp hakkında genel bir değerlendirme yazısı olacak ( Evet yazı ! )Yapılan her işte bir sonrakinin daha güzel ve daha profesyonel olması için geri bildirimin önemi tartışılamaz. Bence gayet de güzel ve profesyonel olan kampımız hakkında geneli olumlu yorumlardan oluşan bir yazı olacak bu. Olumlu eleştiri sizi bir yere götürmez pek fazla ama yiğidi öldür hakkını yeme mevzusu da var burada. O zaman başlayalım. Umarım uzun yazıp da sizi sıkmam.

16 Ağustos 2015 Pazar

Kaçınılmaz Son ..

Herkese merhaba !

Dün kampımızın son günüydü. Aslında bu sıfata cuma günü daha layık, zira dün beraber güzel vakit geçirmek adına Hoca'mızın evine kahvaltıya gittik ve günü orada harcadık, bu nedenle de kampa dair bir şey yapmadık. Son günümüzü çok güzel bir şekilde geçirmiş olduk. Unutmadan, dün ve diğer her gün için Ahmet Hocamız, eşi Melike Hanım ve dünyalar tatlısı Bıcırık'a sonsuz döngüye giren bir şekilde teşekkürlerimi iletmek istiyorum. Kampımızın bu denli sıcak olmasındaki etkileri 10 üzeri bir sürü kadar! Buyurun bu da eksikliklerimiz olsa da son beraber fotoğrafımız.



Sabahtan buluşup gittiğimiz  kahvaltıdan sonra hep birlikte sohbet edip, komikli kanallar izleyip insanlara şok olduk.. Daha sonra tabu oynadık ancak zaman kısıtlamamız olduğu için biraz hızlandırılmış bir şekilde oyunu tamamlamak zorunda kaldık. Kim mi kazandı ? Gene dostluk tabii ki! Ne kadar da başarılı bir dostluk, hep kazanıyor.

Daha sonra uzaklara gidecek bizler uçaklarımıza, otobüslerimize doğru yol aldık yavaştan. Neslihan ve ben asla eve ulaşamayacağımızı sanırken ilginçtir ki evlerimize varabildik. Böyle söylememin nedeni 20:30'da olan ve 1 saat sürecek olan uçuşumuzu, gece 3'te eve vararak tamamlayabilmiş olmamız. Bazen yollar o kadar kısa olamayabiliyor maalesef. Ah şu rötar ! 

Stajın genel değerlendirmesini  haftaya yazacağım yazıya saklayacağım için bu yazıyı kısa tutuyorum. Bu nedenle şimdilik kendinize iyi bakın.

Sevgiler :)

FC.

10 Ağustos 2015 Pazartesi

06-08/08/2015 - Til' Next Time, Signing Out...

Hey world! This will be my last post about our Bioinformatics Internship! I have grown wings, and i am flying out of the crew-nest for a test run. Thank you all for following along with me in this amazing journey! A shout out to my mentors, and crew who made this all and event to truly remember. Peace!

9 Ağustos 2015 Pazar

Ağustos 8, 2015

Herkese merhaba, 

Unutkanlığıma verin, dün yazmış olmam gereken blog yazısını biraz gecikmeyle gözlerinizin hizmetine sunuyorum. 

2 Ağustos 2015 Pazar

30/07/2015 - 01/08/2015 - Just a Friendly Reminder: 'First of the month, your rent is due.'

30/07/2015

Today after the Bioinformatics Hackathon, we are back to the old schedule again. We arrived early today to prepare for the day ahead of us. After the some of us had breakfast, we jumped right into preparing the 40 minute presentation. I found that as the number of people working together increases, organization and coordination is key. We all have presentations ready, but we need to put them together. We elected Seyt to organize and prepare the powerpoint presentation. He hooked up his laptop to the projector, and we got to work. After  approximately close to three hours,  we only got twentyfive percent of the powerpoint done.

1 Ağustos 2015 Cumartesi

Buyrun efem... Ağustos 1, 2015

Cumartesi günleri blog yazmanın en keyifli tarafı genelde yaptığımız bir etkinlikten bahsetmek. Hafta içi bizim için çok yoğun geçiyor, çoğu zaman cumartesi de çalışıyoruz ancak yaptığımız etkinlikler, tüm haftanın yorgunluğunu bir anda alıp götürüveriyor. Mesela bugün Seyit'lere misafir olduk ve tam kadro ekibimizle hep beraber mangal yaptık. Maksat muhabbet tabi. Ateş önü muhabbeti başka olur. Biz de hem muhabbet ettik hem aç karnımızı doyurduk :) Hem çay da vardı. Hani şu demleme olanından. 

31 Temmuz 2015 Cuma

Temmuz' u Bitirirken...

Herkese Merhaba !
Kampımız yine her zamanki yoğunluğuyla hatta daha fazlasıyla devam etmekte. En son, Türkiye' de bir ilk olan "Biyo Hackathon" etkinliğini 48 saat süreyle geçirdik. Bu etkinliğin çok faydalı olduğunu ve hepimize birçok şey kattığını düşünüyorum. Hackathon' da ne yaptığımızı anlatan bir yazıyı kişisel blogumda paylaşacağım. Bu yüzden şimdilik hackathon' u bir kenarda bırakalım.
Hackathon' un yoğunluğuyla yorulan bünyelerimiz bugün biraz dinlenmiş oldu. Güne  http://agar.io/ diye bilinen eğlenceli oyunu oynamakla başladık. Oyuna bir hücre olarak başlıyorsunuz. Amaç kendinizden küçük hücreleri yiyerek büyüme, büyüdükçe puan kasmak. Ayrıca takım halinde de aynı server' da oynanabiliyor. Oyunun ardından Ahmet Hoca, agar.io ya benzer bir uygulamayı, bir javascript eklentisi olan d3 ile yapabilir miyiz diye düşünmemizi, pseudocode geliştirmemizi söyledi. Ardından işin kodlama kısmına geçtik ve http://d3js.org/ ile kodlamaya başladık. d3' ün güzelliklerini ve kullanıcıya sağladıkları olanakları merak edenler linkten ulaşabilir. d3 bir çeşit javascript kütüphanesi. Bu kütüphaneyi kullanarak ve html koduna ekleyerek daha interaktif uygulamalar geliştirebiliyorsunuz. Ahmet Hoca ile beraber ekranda farenin konumuna göre hareket eden bir daire yaptık. Söylendiği kadar kolay ve kısa bir kodu yok maalesef bunun. Ardından ekranda rastgele beliren küçük daireler yaptık ve dairemiz bunların üstüne geldiğinde büyüyordu. Bu uygulamayı bitirdikten sonra herkes, ekranda rastgele konumlarda beliren 10 adet daire yapmaya çalıştı ve herkes yaptı. Ancak burada bir sorun vardı ki o da; ekranda beliren dairelerin birbirinin üstünde de belirmesiydi. Bu tabii ki istemediğimiz bir olaydı. Ahmet Hoca bunu nasıl çözümleyebileceğimizi anlattı ve beraber bu sorunu da aştık. Böylece elimizde 2 tane küçük sayılabilecek ancak temelden bizlere çok şey katan uygulamalarımız oldu.
Nice uygulamalar geliştirmemiz dileğiyle...

Esen kalın, bilimle kalın...

30 Temmuz 2015 Perşembe

30 Temmuz

Merhabalar!

Yaptığımız hackathon etkinliğimizde iki gün uykusuz kalmanın sonucunda sağlam bir dinlenmeyi hak etmiştik ve çarşamba günü öğleden sonrayı dinlenmeye ayırdık. Dinlendikten sonra bu sabah, çalışmalarımızı sürdürmek üzere tekrar görev başındaydık.

'Making History' - The First Bioinformatics Hackathon in Turkey

This previous Monday and Tuesday, the crew and Ahmet Rasit embarked on a Hackathon. A hackathon is an event in which computer programmers and others involved in software development (and hardware development), including graphic designers, interface designers and project managers, collaborate intensively on software projects.

27 Temmuz 2015 Pazartesi

23-25/07/2015 - Mission: Loading...

23/07/2015:

Today we started the day off with presentations from Ahmet hoca. He talked for a good two hours. he mainly focused on presentations, and how to excel in them. He gave us a few tricks and made a few suggestions. We were assigned to give a forty minute long group presentation. We each got various topics regarding technology companies, and we had to link, and present them. We are currently seven people, and we had to assign equal amount of time per person.



25 Temmuz 2015 Cumartesi

Gezdik, Gördük ve Tabii ki Öğrendik ! Temmuz 25, 2015

Merhabalar !

Bugün her zamankinden farklı bir yazı olacak bu blog yazısı. Neden derseniz, bugün kendimize izin verdik ve bilgisayarlarımıza gömülmek yerine açık havaya açılalım dedik. Biraz fazla açılmış olacağız ki bugünkü durağımız Nevşehir oldu. Avanos sizin Göreme bizim dolaştık bütün gün. Tabii ki bu önceden kararlaştırılmış bir plandı. Bu nedenle sabah yolluklarımızı hazırlayıp çıktık yola. Kayseri Nevşehir arası çok kısa, İstanbul'daysanız eğer şöyle bir ölçü verebilirim. Siz akşam trafiğinde işinizden evinize gidene kadar biz buradan Avanos'a varmış oluyoruz. Bu nedenle eğlenceli bir yolculukla kısa sürede vardık durağımıza. 

11 Temmuz 2015 Cumartesi

9th to 11th of July 2015

Greetings world! I am Mehmed Canatan and i will be the second person to give you weekly blogs in English. I am responsible for the last three days (Thursday, Friday, saturday) out of our six working days at the Bioinformatics Summer Camp at Genkok located in Kayseri, Turkey. The first three days shall be blogged none other than my elder brother Mustafa Canatan. I am currently a student at Gaziantep University and will attend my second year there next year in the Faculty of Medicine. I am the second by-product of the marriage between a Turkish male; my father Halit, and a Turkish Cypriot female; my mother Ayse alongside the first and third by-products, my elder brother Mustafa whom i mention before and my younger brother Ahmed respectively. We as three brother were all conceived and produced in the United States of America, in Columbus, Ohio. The aim of this blog is to inform readers of the ups and downs on this Bioinformatics course-wave we are riding, so buckle down, here we go!

11 Temmuz Cumartesi ve Biz Yine Buradayız !!

         Herkese merhaba. Ben Fatma. ODTÜ Moleküler biyoloji ve genetik öğrencisiyim. Bugün ilk olmak üzere, her cumartesi buradan sizlerle kampımızın nasıl gittiğini, neler yaptığımızı paylaşacağım.
            
            Bugün cumartesi ve biz haftasonu torpili alarak güne biraz daha geç başladık. Bir araya gelmemizle işlerimizi halletmeye başlamamız bir oluyor zaten. Bugün de aynı şekilde toplanır toplanmaz kod yazmaya başladık. Bugünkü kodumuz, bize verilen FASTA formatındaki bir sekansın içinden, gereksiz satırları çıkararak intron ayıklamaktı. Grup olarak şimdiye kadar en zorlandığımız kod oldu ama kısa fonksiyonlar imdadımıza yetişti sonunda. Bunu yazdıktan sonra başka bir genden, birden fazla ekzon ayırmaya ve bu bulduklarımızı sıralamaya çalıştık. Gün bitti ancak henüz başarılı bir grup çıkmadı. Biz de bunu pazar günü uğraşmak üzere ödev olarak aldık.
             

8 Temmuz 2015 Çarşamba

7 Temmuz Salı

Herkese merhaba,
Ekibimizin en yeni üyesi olarak kendimi tanıtayım,ben Cansu. Moleküler biyoloji ve genetik öğrencisiyim. Bundan sonra burada her hafta salı günlerimizin nasıl geçtiğini sizlere aktarmaya çalışacağım. Hadi başlayalım :) 

Stajımızın bir gününü daha geride bıraktık. Bugüne "Minecraft" adlı, küplerden oluşan açık bir dünyada bir şeyler tasarlamaya/inşa etmeye dayalı oyunu kendi aramızda grup halinde oynayarak başladık. Hocamızın bu oyunu özellikle takım çalışmasında gelişmemiz için oynamamızı istedi. Birkaç küçük teknik aksaklık yaşamış olsak da sonunda istediğimiz gibi gitmeye başlayan oyunumuzda ilerleyen günlerde hep birlikte, kendi belirlediğimiz kurallarla büyük ölçekli bir dünya inşa etmeyi planlıyoruz.